目前有消息称新闻出版总署正与有关部门协商减免实体：11店税费。这似乎是给实体书店一次涅?的机会。但是也有业内A士认为，书店行业必须转型，否则仅仅减免税收是不能救实体书店的
北京的两家光合作用书房直营店毫无预警地停业了。2011年10月29日，光合作用五道口店和现代城店均没有开业。在五道口店一楼杂志区，所有杂志已被清空，二楼图书区内铁门大敞，但所有书架图书一本不剩，书店咖啡屋空留几个杯盘。书店内纸张、灰尘零落满地，一派萧瑟。
据已经“被辞职”的店员介绍，五道口的光合作用书房几年来持续亏损，店内多名员工遭遇欠薪，目前处于失业状态。光合作用书房总经理孙池接受电话采访时称，近几年来，房租、水电等成本急剧上涨，光合作用的销售连续4年下滑，今年更是下滑了40％，销售和成本两头夹击，压力在不断增长。
光合作用书房这个曾经风光无限的民营书店代表，高峰期曾在全国开设31家分店。分析其无以为继的原因，除了书房自身经营不善，管理落后外，来自新华书店体系以及网络书店的竞争是重要原因。
主渠道与二渠道的楚汉之争
从新中国成立到1982年，中国的书店完全国有，新华书店的网络如同邮局，遍布各个大中小城市。当时的出版业完全没有民营企业的影子，实行“统购统销”，也就不存在竞争。1982年，《国家出版局关于图书发行体制改革问题的报告》出台，为民营书店打开了一扇门。
随着民营书店的发展，逐渐形成了与新华书店系统分庭抗礼的局势。于是，出版产业的发行渠道划分为新华书店掌管的“主渠道”，与民营书店代表的“二渠道”，一直沿用至今。’
在20世纪90年代，很多城市部有从个体小书摊成长起来的民营书店，这些书店占据着除教材外的一般图书销售量的半壁江山。根据《中国出版年鉴?1985》，1983年全国书店销售网店数量为75983家，1984年增至113503家，增幅49％。增加的网点绝大多数是民营书店。
民营书店的大量崛起必然给国有书店带来冲击。民营书店经营灵活，服务意识强，市场嗅觉灵敏等特点让国有书店更难与之竞争。
电影《网络情缘》就可以看作展现民营书店与国有书店的缩影的_占父事。电影讲述了两个书店的竞争，一家是大型连锁书店，图书种类齐全，管理规范成熟，但缺乏活力与变通；另一家是角落里的小书店，经营范围狭窄，但员工各个热情洋溢、充满活力。
现实中，民营书店给图书行业带来新感觉。光合作用书房正是其中的代表，萁倡导“在书与非书之间，悦读延伸世界”的理念，为“悦读”营造了舒适的氛围。与光合作用书房同时发展起来了一批个性鲜明的民营书店，通过更周到的服务吸引了大批读者。
可惜，民营书店辉煌期并没有持续太久。从2004年开始，新华书店积极弥补自身不足，不仅大兴土木，更在服务质量、图书种类上下功夫。同时，新华书店的股份制改革拉开帷幕，2007年改革完毕。
改革后的各地新华书店从统购统销的经营模式转轨到自负盈亏的模式，与民营书店基本相同。因为原有的土建直接划分给当地书店，所以即使自负盈亏，新华书店也带有一个先天优势，不需要付房租。省去了房租的烦恼，新华书店系统内的书店成本比民营书店下降了很多，竞争力自然提高了。但是，不是所有地方新华书店都一帆风顺，一些冗员众多，经营不灵活的书店也被合并或整合起来。
另外，新华书店网络覆盖面广，整合后的规模效应得到很好体现。连锁式的新华书店系统的图书销售网络更宽了，自然就有了向出版社讨价还价的筹码，例如要求更大的折扣和更长的账期。业内人士介绍，现在，出版社给丰渠道的折扣账期会比二渠道长几个月，折扣基本已经可以一碗水端平，省店的折扣可能比下级店多些，但是折扣基本会按照订货量和以往合作情况而定。
传媒大学出版社的一位资深发行人员对记者说，新华书店的网络就像邮局一样，很小的县城都有，所以能够承接大项目，比如农家书屋，这个特质是民营书店不能比的。
农家书屋是专门为满足农民需求，引导农民阅读而在行政村建立的、农民自己管理的、能提供农民实用的书报刊和音像电子产品阅读视听条件的公益性文化服务设施。自2008年项目起动，到2011年8月，全国共建设农家书屋38万家，2012年预计建设50万家，覆盖全国。如此大的订货、送货量，只有新华书店系统有能力承接。
新华书店系统的另一个优势是中小学教材的“独家发行权”。据黑龙江出版总社教材部黄铁锋介绍，在我国，中小学教材的发行都是首先由教育行政部门和出版部门联合审定，确定书目后交由新华书店征订，备学校选用。教育系统汇总报数给新华书店，由出版总社统一印制，新华书店在拿到教材后送到各个学校。很明显，中小学教材被新华书店系统垄断了。垄断代表着高利澜和定价权，新华书店从中小学教材的发行获取了较高利润。
实体书店的困境
从国有书店的优势不难看出，民营书店与之竞争的空间很有限，只能通过加强自身的经营管理和市场推广两方面突围。网络书店的蓬勃发展让夹缝中生存的民营书店活得更辛苦，也让树大根深的国有书店尝到了苦头。一方面，网络书店不需要店面，大大降低了运营成本。另一方面一些网络书店为了提高点击率不计利润，把价格下调到与成本持平甚至低于成本。
1995年创立的亚马逊公司是网络书店的鼻祖，从此电子商务给图书销售带来了翻天覆地的变化。2002年亚马逊第四季的净利润约有500万美元；2011年亚马逊第一季的销售额达到98亿美元，净利润2亿美元。
网络书店凭借更低的折扣、更广泛的书目和更方便的检索方式等特点逐渐代替了实体书店。足不出户就能买到图书，既节省了时间又节省了金钱，因此成为读者购书的首选。民营书店在网络书店的冲击下大量倒闭，新华书店也有所收缩。2004年上海思考乐书店倒闭；2009年上海昂立书店停业。不仅在中国，外国大型书店也不敌网络书店。2011年2月，拥有674家分店的世界第二大书店连锁巨头、美国鲍德斯(Borders)递交了破产申请。
对于光合作用书房北京直营店的倒闭，新闻出版总署副署长阎晓宏表示，不能把民营书店的倒闭完全归结为经营不善。当前实体书店经营困难主要有两个原因，一是网络书店和大型书城的冲击，另一个是价格原因。
电子商务的冲击下，实体书店的经营都面临困难，民营书店更甚。书店与出版社之间采用赊销制，书店需要坚强的现金流来支撑进货。现金流一旦断裂，书店不能支付出版社账款，出版社就不会再给书店发书，书店没有新书，也就不能吸引读者，陷入恶循环。已经有不少书店拖欠大量出版社账款最后只能关门躲债的例子。
林业出版社的发行人员说，实体书店也不是到了绝境。有一些书店与当地的出版公司结成同盟，形成出版集团，然后打包上市。出版集团拥有图书全产业链，打通从图书的制作到终端销售的各个环节，形成产供销一条龙，比单一的出版社和书店都更具竞争力。
已经在港交所上市的四川新华文轩连锁股份有限公司，由四川新华发行集团有限公司与多家新闻出版产业集团联合，按照上市公司标准建立的我国第一家大型股份制出版发行企业。其中，持股85，92％四川新华发行集团公司控股股份公司就是四川新华书店。之后，安微、江西和湖南的新华书店省店也纷纷上市。
目前有消息称新闻出版总署正与有关部门协商减免实体书店税费。这似乎是给实体书店一次涅?的机会。但是也有业内人士认为，书店行业必须转型，否则仅仅减免税收是不能救实体书店的。