水是生命之源，水资源是人类生存发展的物质基础，是农业可持续发展的重要保障。然而，当今水资源供给与需求之间存在着尖锐矛盾，这一矛盾已成为人类社会发展的强力制约因素。水资源优化配置是解决这一矛盾的有效途径之一，因此防止水土流失具有重要的意义。
1.因地制宜，搞好规划
应以巴音沟河流域地区社会经济、人口、资源和生态环境的协调发展为基础，以可持续发展作为水资源优化配置为指导思想。根据人口及社会的需要平衡各项指标，改善生产结构，促进各业协调发展。既要加强生态建没，走向良性循环，更要积累资源，进行转化，增加经济收入。规划的区域以小流域为单元，行政区划也要考虑，以便更好地组织实施。综合治理主要内容是建立植物、工程、蓄水保土耕作、径流水路等四项措施的体系，相互配合，发挥群体防护作用。各项措施都应有仔细的设计和实施步骤。规划必须把“实现生态环境改善，资源有效利用，促进人与自然和谐相处，以水土资源的可持续利用维系良好的生态环境，促进经济社会可持续发展”作为重要目标，达到水土流失治理和经济收入增长双赢。
2.治理水土流失，应突出治水
坡面径流是侵蚀土壤的动力，控制坡面径流，能有效防止水土流失发生，控制坡面径流主要采取工程措施。坡面布设以截流沟，使坡面径流流速未达到冲刷流速前就被拦截，有效防止土壤免遭冲刷。充分利用坡面径流则除灾兴利。沟道侵蚀是重要的侵蚀形式，沟道侵蚀主要有沟岸扩张、沟床下切和溯源侵蚀三种形态，沟道侵蚀的主要动力是洪水径流和洪水径流携带的固体物质（沙石）造成河床淤积，行洪防洪能力下降，农田毁坏，水利和沟道防洪工程被破坏。沟道侵蚀治理，必须采取工程植物措施结合，采取封沟打卡、修堤筑坝、固岸护滩、林网防护等措施综合防治。径流管理应是小流域治理的主要内容。
3.以建设稳产、高产基本农田为重点，退耕还林还草，全面控制水土流失
治理既是控制水土流失的需要，也是实现可持续发展战略，实现两高一优农业，建设稳产、高产基本农田，农业生产发展的需要。只有建立优质高产的基本农田，农产品才能稳定增长，只有建立优质高产的基本农田，农民才能从世代沿袭的广种薄收中走出来，才能实现土地利用结构调整，实现生产要素的优化配置，使大部分不宜耕种的荒地、陡坡地退耕还林还草，才能发展经济作物，才能巩固退耕还林成果。
4.培育资源，发展商品经济
开展小流域治理，其宗旨并不仅是治理水土流失，其目标主要有四个方面：建立良好的生态环境；提高土地生产率；使农民有显著的增收；水土流失基本制止。因此在小流域治理中，不仅要看治理了多少面积，蓄了多少水，保了多少土，而且要看打了多少粮食，增加了多少经济收入，培育了多少资源，建立了多少商品开发的项目。所以在治理中，应选择有开发前途的物种，集中培育，开发利用，增加收入。
5.构架立体型生态经济生产体系
5.1种群合理搭配 需要选择对大环境要求基本相同而具体特性差异很大、甚至相反的植物进行搭配，做到彼此促进生长。在地上部分应考虑速长与慢生、喜阴与喜阳、高干与矮干、针叶与阔叶、豆科与非豆科等植物搭配；地下部分应考虑深根与浅根、多主根与多须根、喜水与耐旱、摄取营养物质差异性大等植物搭配。要研究植物总体的一致性和具体的相反性。
5.2建立多层次的结构，垂直利用空间 形成多层次、多种类、多产品、多收益的生态系统，应该研究仿照大自然生态进行组合。
5.3实行林粮、林果、林药等多种间作 间种的植物利用空间与地下营养不同，可获得更多的效益。
5.4综合经营，一物多用 绿肥植物蕴藏着无穷无尽的宝贵财富。有的树木既可作木材又可产油料，有的可提取纤维或淀粉，有的材药两用，有的枝叶营养丰富可发展饲养业。野生动物和鸟类资源增多等，均应注意集中成片培育，开发利用。
6.深化改革，建管结合，整体推进
随着农村改革的深入，对小流域治理工程建设提出了新的要求，要研究深化产权制度改革，积极推行户包、租赁、股份合作等多种治理形式，加快水土流失治理步伐；推行多种施工管理模式，采用专业施工队和群众会战、常年治理与冬春季集中治理、人工与机械施工相结合等方法的同时，对重点治理工程推行合同制、招投标制、质量监理制，确保施工质量；完善制度，充分调动群众参与流域治理的积极性，真正把流域治理与群众切身利益结合起来；深化项目建设和管理机制改革。尊重市场经济规律，加快建立以市场为导向的项目建设和管理机制，拓宽投资渠道。
7.加强预防监督执法，切实巩固治理成果
加强预防监督是搞好水土保持工作的重要方面，按照“大封禁、小治理”的治理思路，进一步扩大封禁范围。坚决查处水保大案要案。依法严格审批生产建设项目水土保持方案。加强监督监管，建立健全执法体系，加强执法活动。做到治理一片、管护一片、巩固一片、受益一片。